XR250 (MD30) также называется «Super XR» из концепции разработки. Представленный в 1995 году как преемник XLR250R (в то же время дебютировала и XR Baja), претерпев несколько незначительных изменений и полное изменение модели в 2003 году с добавлением кожуха бака. Причина прекращения производства была связана с правилами выхлопных газов в то время. Во второй половине модель жила отдельно от XR230, а XR230 выпускался и после окончания XR250, но в итоге из каталога выпал. Honda пришлось ждать до выпуска CRF250L в 2012 году для дорожного внедорожного мотоцикла.
Последняя модель XR250, в которой используется матовая серая трубка ручки и хромированная крышка топливного бака для улучшения текстуры. В сентябре этого года правила по выхлопным газам (правила 2006 года) были применены к продолжающимся серийным моделям, и срок службы модели закончился.